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至云计算成基因检测“宠儿”

时间:2021年10月12日

云计算成基因检测“宠儿”

云计算正在成为生物医学界的 宠儿 。近日,北京贝瑞和康生物技术有限公司与阿里云共同向外界宣布双方达成合作,共同打造以海量的中国人群基因组数据为核心的数据云,实现对个人基因组数据的精准解读。

两巨头协力欲建国人基因组大数据

打造基因组大数据,相当于建立了1个中国人基因版的《本草纲目》,将记载中国人群核心的基因信息、生命信息,为中国人群重大疾病的预测、预防、诊断和医治奠定基础。它的意义将不亚于《本草纲目》这部东方医药巨典。 贝瑞和康首席生物信息官于福利博士说。

中国是世界诞生缺点率多发地区之1。以满足预定用处或利用领域的需要每一年1600万至2000万的诞生人口中,有80万至120万诞生缺点儿。1996年到2010年,中国新生儿诞生缺点产生率增幅达70.9。这1不利的局面”将随着 神州基因组数据云 项目的实现得到改观。据了解,贝瑞和康自主构建的中国人群基因组大数据库目前已包括超过410万份基因组数据。通过314由矿物胶凝材料和EPS集料组成的绝热抹灰系统对该数据资源的深入发掘,能够进1步揭露中国人群遗传突变散布,这将极大助益于提升中国人遗传疾病诊断的效力和精准程度。

贝瑞和康CEO周朝星称,1个人有300多万个位点突变,这些突变哪些是成心义的,哪些是没成心义的,中国截至目前还没有这样详细的图谱。而贝瑞和康与阿里云合作,就是希望建立中国人易感位点的数据库。而1旦这1数据库建成,这对7000多种临床疾病的解读将有积极意义。

牵手背后是基因云计算热

据了解,新1代基因测序技术要得到比较准确的信息,1般认为30X的基因测序深度是初期人们用布袋艳服食粮必须的,所以1个人的基因组检测大约需要产生90Gb的数据。如此大的数据,在1般的电脑或小型服务器上运行起来非常困难。

而要对40万个样本进行计算,这对计算能力要有非常高的要求,而阿里云正好能提供这样的计算和分析能力。

阿里云专家林河山表示:双方合作阶段主要是提供存储、计算资源、方便使用;第2个阶段,在协商1致的情况下,可能会探讨利用大数据展开合作,让数据工具与医疗相结合。林河山称,阿里大数据方面已通过天猫医药馆和阿里健康有了较好的积累,将有助于双方第2阶段合作。

云计算参与基因检测有着巨大的潜力,以美国为例,就已有比较成功的先例。比如谷歌旗下的DNANEXUS和7桥基因公司等在云上提供生物信息服务的公司。 林河山如是说。

至于项目商业化路径,贝瑞和康CEO周朝星坦言,目前主要是针对医疗机构。据他流露,国内有20多家医院已被批准可以做遗传基因的检测,而检测需要更好的解读,这就是 神州基因组数据云项目 较为不言而喻的价值所在。

业内人士指出,随着下1代基因测序、生物资谱和医学成像等医学技术的迅猛发展,大数据浪潮将根本性的改变生物医学基础研究和医疗实践。